MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 4272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009468	CAT	2	6	22296	22301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243824
502	NC_009468	CTT	2	6	22303	22308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243824
503	NC_009468	TTC	2	6	22340	22345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243824
504	NC_009468	GGT	2	6	22373	22378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243824
505	NC_009468	CGG	2	6	22444	22449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243824
506	NC_009468	AAGC	2	8	22615	22622	50 %	0 %	25 %	25 %	148243824
507	NC_009468	GTTGG	2	10	22685	22694	0 %	40 %	60 %	0 %	148243824
508	NC_009468	GC	3	6	22727	22732	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
509	NC_009468	GC	3	6	22841	22846	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
510	NC_009468	TATCT	2	10	22857	22866	20 %	60 %	0 %	20 %	148243824
511	NC_009468	GCC	3	9	22874	22882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243824
512	NC_009468	TAC	2	6	22884	22889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243824
513	NC_009468	GGC	2	6	22909	22914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243824
514	NC_009468	CGT	2	6	22936	22941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243824
515	NC_009468	GCTC	2	8	22996	23003	0 %	25 %	25 %	50 %	148243824
516	NC_009468	ATC	2	6	23004	23009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243824
517	NC_009468	GCG	2	6	23069	23074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243824
518	NC_009468	TCA	2	6	23127	23132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243824
519	NC_009468	ACT	2	6	23208	23213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243825
520	NC_009468	ATC	2	6	23230	23235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243825
521	NC_009468	GCT	2	6	23275	23280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243825
522	NC_009468	CGG	2	6	23292	23297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243825
523	NC_009468	GCAC	2	8	23338	23345	25 %	0 %	25 %	50 %	148243825
524	NC_009468	CGC	2	6	23352	23357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243825
525	NC_009468	CTG	2	6	23492	23497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243825
526	NC_009468	CTG	2	6	23551	23556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243825
527	NC_009468	TCG	2	6	23705	23710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243825
528	NC_009468	GAG	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243825
529	NC_009468	AAC	2	6	23768	23773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243825
530	NC_009468	CAT	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243825
531	NC_009468	CGC	2	6	23829	23834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243825
532	NC_009468	ATGG	2	8	23845	23852	25 %	25 %	50 %	0 %	148243825
533	NC_009468	GCA	2	6	23866	23871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243825
534	NC_009468	TGCGGC	2	12	23883	23894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243825
535	NC_009468	CGC	2	6	23916	23921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243825
536	NC_009468	CCG	2	6	23930	23935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243825
537	NC_009468	TGA	2	6	23987	23992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243825
538	NC_009468	GCC	2	6	24008	24013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243825
539	NC_009468	CCAG	2	8	24061	24068	25 %	0 %	25 %	50 %	148243825
540	NC_009468	GGC	2	6	24129	24134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243825
541	NC_009468	GGCC	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	148243825
542	NC_009468	GCTGA	2	10	24214	24223	20 %	20 %	40 %	20 %	148243825
543	NC_009468	C	8	8	24347	24354	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
544	NC_009468	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_009468	GCGGT	2	10	24428	24437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
546	NC_009468	GACG	2	8	24449	24456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_009468	CG	3	6	24506	24511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_009468	CGAC	2	8	24527	24534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009468	GCT	2	6	24539	24544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009468	A	6	6	24671	24676	100 %	0 %	0 %	0 %	148243826
551	NC_009468	CGC	2	6	24754	24759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243826
552	NC_009468	CG	3	6	24792	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	148243826
553	NC_009468	ATG	2	6	24800	24805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243826
554	NC_009468	TCG	2	6	24806	24811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243826
555	NC_009468	CGC	2	6	24814	24819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243826
556	NC_009468	GT	3	6	24822	24827	0 %	50 %	50 %	0 %	148243826
557	NC_009468	TCG	2	6	24951	24956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243826
558	NC_009468	CTC	2	6	24959	24964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243826
559	NC_009468	AT	3	6	25008	25013	50 %	50 %	0 %	0 %	148243826
560	NC_009468	GCGG	2	8	25137	25144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
561	NC_009468	CGC	2	6	25189	25194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_009468	TCC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_009468	TCA	2	6	25266	25271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009468	TCA	2	6	25323	25328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243827
565	NC_009468	CGG	2	6	25341	25346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243827
566	NC_009468	CGC	2	6	25402	25407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243827
567	NC_009468	GAT	2	6	25419	25424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243827
568	NC_009468	AGC	2	6	25483	25488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243827
569	NC_009468	GCG	2	6	25525	25530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243827
570	NC_009468	T	6	6	25556	25561	0 %	100 %	0 %	0 %	148243827
571	NC_009468	TCA	2	6	25585	25590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243827
572	NC_009468	A	6	6	25613	25618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009468	AGA	3	9	25646	25654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009468	CAA	2	6	25666	25671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009468	ACGC	2	8	25691	25698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_009468	ATT	2	6	25706	25711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243828
577	NC_009468	ATCC	2	8	25775	25782	25 %	25 %	0 %	50 %	148243828
578	NC_009468	CGA	2	6	25787	25792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243828
579	NC_009468	CGG	2	6	25897	25902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243828
580	NC_009468	CGC	2	6	25919	25924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243828
581	NC_009468	GCCG	2	8	26012	26019	0 %	0 %	50 %	50 %	148243828
582	NC_009468	CGGC	2	8	26043	26050	0 %	0 %	50 %	50 %	148243828
583	NC_009468	TGGG	2	8	26071	26078	0 %	25 %	75 %	0 %	148243828
584	NC_009468	TAT	2	6	26123	26128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009468	CACT	2	8	26257	26264	25 %	25 %	0 %	50 %	148243829
586	NC_009468	TGC	2	6	26271	26276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
587	NC_009468	CTG	2	6	26335	26340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
588	NC_009468	CCCG	2	8	26366	26373	0 %	0 %	25 %	75 %	148243829
589	NC_009468	ACTG	2	8	26457	26464	25 %	25 %	25 %	25 %	148243829
590	NC_009468	CAT	2	6	26584	26589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243829
591	NC_009468	ACC	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829
592	NC_009468	GCC	2	6	26633	26638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
593	NC_009468	CGC	2	6	26649	26654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
594	NC_009468	GTTC	2	8	26661	26668	0 %	50 %	25 %	25 %	148243829
595	NC_009468	CCA	2	6	26704	26709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829
596	NC_009468	CGG	2	6	26719	26724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
597	NC_009468	GATTG	2	10	26773	26782	20 %	40 %	40 %	0 %	148243829
598	NC_009468	CG	3	6	26804	26809	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
599	NC_009468	ATT	2	6	26840	26845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243829
600	NC_009468	CG	3	6	26864	26869	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
601	NC_009468	GC	3	6	26911	26916	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
602	NC_009468	AC	3	6	26954	26959	50 %	0 %	0 %	50 %	148243829
603	NC_009468	ATC	2	6	27019	27024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243829
604	NC_009468	GGC	2	6	27054	27059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
605	NC_009468	TCT	2	6	27107	27112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243829
606	NC_009468	ACCT	2	8	27166	27173	25 %	25 %	0 %	50 %	148243829
607	NC_009468	ATCG	2	8	27201	27208	25 %	25 %	25 %	25 %	148243829
608	NC_009468	CTC	2	6	27270	27275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243829
609	NC_009468	GGGAGG	2	12	27290	27301	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	148243829
610	NC_009468	CTC	2	6	27397	27402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243829
611	NC_009468	CGC	2	6	27425	27430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
612	NC_009468	GCT	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
613	NC_009468	TGGG	2	8	27539	27546	0 %	25 %	75 %	0 %	148243829
614	NC_009468	CTGA	2	8	27595	27602	25 %	25 %	25 %	25 %	148243829
615	NC_009468	CCG	2	6	27609	27614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
616	NC_009468	CCA	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243829
617	NC_009468	TGG	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243829
618	NC_009468	CGGG	2	8	27715	27722	0 %	0 %	75 %	25 %	148243829
619	NC_009468	CGC	2	6	27789	27794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
620	NC_009468	TGA	2	6	27834	27839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243829
621	NC_009468	GCC	2	6	27850	27855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243829
622	NC_009468	GCG	2	6	27856	27861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
623	NC_009468	GC	4	8	27976	27983	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
624	NC_009468	GTC	2	6	28006	28011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
625	NC_009468	CTGGAT	2	12	28021	28032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243829
626	NC_009468	CTG	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
627	NC_009468	AG	3	6	28079	28084	50 %	0 %	50 %	0 %	148243829
628	NC_009468	GGC	2	6	28088	28093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243829
629	NC_009468	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
630	NC_009468	TCG	2	6	28121	28126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243829
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